Gli organi del CIPEI sono:
il Direttore: Massimo M. Augello
il Comitato scientifico, composto dal Direttore (Massimo M. Augello), dal responsabile del Sistema Bibliotecario dell’Università di Pisa (Gabriella Benedetti) e da tutti i docenti appartenenti ai settori scientifico-disciplinari di Storia del pensiero economico e di Storia economica delle Università di Firenze, Pisa e Siena;
il Consiglio direttivo, composto dal Direttore (Massimo M. Augello), dai tre membri nominati rispettivamente dai rettori degli Atenei fondatori (Piero Bini, Massimo Di Matteo, Marco E.L. Guidi), dal coordinatore organizzativo del Sistema Bibliotecario dell’Università di Pisa (Gabriella Benedetti) che svolge anche le funzioni di segretaria del Consiglio direttivo.
Massimo Mario Augello
Piero Bini
Massimo Di Matteo
Marco Guidi